保护区自建立以来，在上级主管部门的领导下，始终围绕保护生物多样性、自然景观，第四纪冰川遗迹，古文化遗产和重要的水源涵养地这个总目标，贯彻执行国家有关自然保护的方针、政策及法律、法规，在自然资源保护、综合考察、科学研究、公众教育、基本建设等方面，均取得了较好的成绩。
    切实保护好珍贵的自然资源和典型的自然环境是我局管理工作的重点。保护区管理局现有保护科、防火办、科研科、社区工作科等7个科室，蒿坪、鹦鸽、厚畛子、黄柏塬和嘴头5个基层保护站和蒿坪、鹦鸽2个林业公安派出所。资源保护工作始终坚持实行“领导包片、科室包站、分区划段、小组承包”责任制，按照《巡护计划》和《监测计划》，认真巡护和监测。坚持以科学研究为依据，以宣传教育为先导，以巡护检查为保障，积极开展综合管理，与毗邻单位社区开展联防护林，依法保护着我区各类自然资源。
    一是组织职工认真学习党和国家有关林业、自然保护区等方面的法律、法规及方针政策，提高全体职工的保护意识，增强每个职工的责任感。
    二是下大力气解决了保护区与周边社区长达15年之久的林权争议问题，为保护好区内资源奠定了基础。
    三是依法查处破坏自然资源的案件，防范与打击破坏自然资源的不法行为。
    四是加大社区宣传教育工作的力度，每年集中时间、集中人力在社区广泛深入地开展自然资源保护宣传教育，向沿区群众宣传自然资源和生态环境保护的重要性，积极在社区中小学校举办自然保护知识竞赛和生物多样性夏令营等活动，大大地提高了社区群众和中小学生的保护意识。
五是森林防火工作坚持“预防为主，积极消灭”的方针，狠抓了宣传教育、组织机构建设、防火基础设施设备建设，严格火源管理，全面落实各项防范措施，因此保持了建区40年无森林火灾的好成绩。1986年，被评为全国林业系统自然保护区先进单位，受到林业部的嘉奖；1993年受到国家人事部、林业部的嘉奖，被授予“三年无森林火灾先进单位”的称号；2001年被省林业厅评为护林防火先进单位。